Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot9Q9JKY0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot9Q9JKY0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot9Q9JKY0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot9Q9JKY0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot9Q9JKY0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot9Q9JKY0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot9Q9JKY0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot9Q9JKY0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms