Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Upk3aQ9JKX8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Upk3aQ9JKX8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Upk3aQ9JKX8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Upk3aQ9JKX8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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