Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.7 ms