Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms