Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Ybx3Q9JKB3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms