Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms