Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gfra4Q9JJT2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms