Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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Bco1Q9JJS6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Bco1Q9JJS6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Bco1Q9JJS6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Bco1Q9JJS6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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