Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scube2Q9JJS0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms