Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ccdc86Q9JJ89 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ccdc86Q9JJ89 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ccdc86Q9JJ89 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ccdc86Q9JJ89 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ccdc86Q9JJ89 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ccdc86Q9JJ89 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ccdc86Q9JJ89 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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