Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.4 ms