Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms