Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms