Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn2Q9ER65 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms