Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx12Q9ER00 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms