Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms