Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms