Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms