Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD03

Rab13, Ras-related protein Rab-13, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab13Q9DD03 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Rab13Q9DD03 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rab13Q9DD03 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rab13Q9DD03 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Rab13Q9DD03 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab13Q9DD03 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab13Q9DD03 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab13Q9DD03 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab13Q9DD03 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab13Q9DD03 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab13Q9DD03 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab13Q9DD03 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Rab13Q9DD03 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab13Q9DD03 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab13Q9DD03 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab13Q9DD03 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab13Q9DD03 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab13Q9DD03 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab13Q9DD03 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms