Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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