Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms