Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms