Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms