Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms