Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcg8Q9DBM0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcg8Q9DBM0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms