Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms