Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms