Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cldn34b2Q9D9N2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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