Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9I4

Tbc1d20, TBC1 domain family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d20Q9D9I4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d20Q9D9I4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d20Q9D9I4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms