Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms