Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms