Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc91Q9D8L5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc91Q9D8L5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc91Q9D8L5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc91Q9D8L5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc91Q9D8L5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms