Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn23Q9D7D7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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