Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms