Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Necab3Q9D6J4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms