Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms