Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms