Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms