Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms