Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5R4

Spata1, Spermatogenesis-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata1Q9D5R4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata1Q9D5R4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms