Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D5Q8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D5Q8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms