Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3404Q9D506 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gm3404Q9D506 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Gm3404Q9D506 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Gm3404Q9D506 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Gm3404Q9D506 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm3404Q9D506 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm3404Q9D506 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm3404Q9D506 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm3404Q9D506 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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