Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms