Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf3Q9D4H7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms