Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms