Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D454 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D454 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D454 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D454 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D454 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D454 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D454 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D454 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D454 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D454 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D454 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D454 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D454 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D454 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D454 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D454 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D454 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D454 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D454 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D454 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D454 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D454 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D454 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D454 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D454 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D454 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D454 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D454 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D454 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D454 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D454 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D454 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D454 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D454 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D454 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D454 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D454 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D454 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D454 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D454 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D454 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D454 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D454 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D454 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D454 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D454 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D454 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D454 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D454 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D454 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D454 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D454 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D454 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D454 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D454 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D454 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D454 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D454 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D454 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D454 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D454 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D454 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D454 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D454 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D454 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D454 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D454 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D454 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D454 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D454 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D454 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms