Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms