Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpn3Q9D3W4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms