Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D2Q3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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