Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D1F3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms